趙昺在萬州盤恒三日，又召見了剛剛從陵水縣返回的萬州知軍蔣科，其是寶佑年間進士，曾任瓊山教谕，其文采卓著，弘揚文教，廉法事教，頗有建樹被舉薦為宜倫ＷwＷ..lā＞≥在任上撫輯俚硐，教以詩書，深受俚人尊敬，帥府整饬吏治将其升任萬安知軍。

　　趙昺吩咐他蔣科用大軍屯駐在此的機會，與俚人劃定界線，約束其行為，減少與當地居民的糾紛，創造一個穩定的局面。其後他又叮囑韓振要配合好地方工作，該出人出人，該出力出力。同時加緊練兵，做好戰備，一旦有警，可以拉的動，用的上，頂得住。不僅能守住一方之地，還要做好随時增援瓊州的準備。

　　趙昺的意思很清楚，他想将右軍打造成一支水6兩栖部隊，即精于6戰，又精于水戰。這種考慮也是基于現實考慮，因為此時的水戰可以說是6戰的延伸，并非現代意義上争奪制海權的海戰，而是以消滅敵人有生力量，削弱其戰鬥力為目的的戰鬥。

　　所以海戰傷亡巨大是難免的，且海上行舟不可意料的風險也比6地上大的多，一場風暴便可将船隻摧毀，溺死的人都是以千百論，更有甚者一支艦隊都可能毀于一場飓風。而右軍中的士兵多是由福建沿海地區的義勇組成，他們生活在海邊，熟悉水性，适應船上的生活。讓他們修習水戰，一旦水軍失利造成重大傷亡，可以讓他們替代船上的戰兵。

　　而讓趙昺選定右軍除了考慮到兵員組成外，還有便是主将韓振。其是殿前禁軍出來的，而殿前禁軍的主要任務便戍邊和保護京師及皇帝的安全，受到的教育也是将忠于皇家放在第一位，耳染目睹之下多少怎麼也會在其心中打下烙痕。再有韓振在禁軍中地位不高，又有股二杆子勁兒，各方勢力都不會将他作為拉攏的對象，也就是說政治上清白，不會輕易被朝中大佬們左右。

　　另一方面，跨海攻擊敵占區，騷擾沿海，占領敵軍海港，并摧毀他們的戰船，借以打亂敵人的部署，将會成為帥府水軍的一項常态話任務，而這些任務有的單憑水軍是難以獨立完成的，這便需要步軍的配合。而這又要求配合作戰的步軍，不僅精通6戰，且要熟悉水戰。其作戰任務和訓練方式與現代的海軍6戰隊類似，那經過兩栖作戰訓練的右軍便成為選。

　　當然趙昺安排不僅限于右軍。中軍是帥府軍的核心力量，征戰中其擔負着警衛帥府及保證殿下安全的重任，因而就要求它擅于防守，而不是長于進攻，所以趙昺把中軍作為守衛瓊州的主要力量；前軍是一軍的先鋒，主要作戰任務便是逢山開路遇水填橋，攻城掠地，掃清大軍前行的一切障礙，本應将其布置在瓊州作為反擊敵登6的主要力量，但因為後軍之事，隻能暫安置在‘大後方’吉陽軍。

　　而後軍基本都是新收編的義勇，戰鬥力最弱，趙昺最初才想将他們安排在瓊州作為維穩地方的主要力量和後備軍使用，卻沒想到屁股還未在瓊州坐熱便被江璆帶到了雷州，參加了收複三州的戰鬥。此後幾個月鎮守于此又與敵多次生小規模的沖突，雖然造成了一定的傷亡，卻在戰鬥中得到了鍛煉，成為帥府軍實戰經驗最豐富的部隊。